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Linha de pesquisa
Biologia de Patógenos
Linhas gerais/General outline
Estudamos mecanismos, elementos e genes envolvidos no controle da expressão gênica no parasito Leishmania empregando genômica/proteômica comparativa e genética reversa.
Linhas de pesquisa/Research areas
Estudamos processos e mecanismos de regulação da expressão gênica associados a abordagens de genômica comparativa no parasito Leishmania. Investigamos a presença de ncRNAs (RNAs não codificadores) e atualmente estudamos um desses ncRNA responsável pela regulação da expressão de outros genes e as alterações fenotípicas que a modificação de seu nível de expressão induz. Um outro alvo de investigação sobre regulação de expressão gênica é uma proteína ribossomal (L19) que, tem expressão variável durante o ciclo de vida do parasito e pode exercer funções extra-ribossomais. Outros aspectos da regulação de expressão gênica são abordados e envolvem os genes que codificam para as fosfoglicerato quinases (PGK) em L. major, nele buscamos identificar e caracterizar cis-elementos envolvidos no controle de expressão gênica. Após a colaboração para a compleição dos genomas de L. major e L. braziliensis, prosseguimos com estudos de genômica/proteômica comparativa e exploramos a baixa conservação de seqüência das regiões intergênicas como ponto de partida para identificar novos elementos regulatórios de expressão dos genes. Estudos conduzidos sobre atenuação de virulência em mutante superexpressor do gene responsável pelo processamento dos mRNAs (spliced leader RNA, SLRNA) nos levaram a estudar os mecanismos moleculares da atenuação, que também estão envolvidos em processos de controle de expressão gênica nesse protozoário.
Principais Artigos dos últimos 5 anos:
1. Intrinsically disordered proteins (IDPs) in trypanosomatids.
Ruy PC, Torrieri R, Toledo JS, Alves Vde S, Cruz AK, Ruiz JC.
BMC Genomics. 2014 Dec 13;15:1100. doi: 10.1186/1471-2164-15-1100.
PMID: 25496281
2. Altered expression of an RBP-associated arginine methyltransferase 7 in Leishmania major affects parasite infection.
Ferreira TR, Alves-Ferreira EV, Defina TP, Walrad P, Papadopoulou B, Cruz AK.
Mol Microbiol. 2014 Oct 8. doi: 10.1111/mmi.12819.
PMID: 25294169
3. Characterization of the pattern of ribosomal protein L19 production during the lifecycle of Leishmania spp.
de Almeida-Bizzo JH, Alves LR, Castro FF, Garcia JB, Goldenberg S, Cruz AK.
Exp Parasitol. 2014 Dec;147:60-6. doi: 10.1016/j.exppara.2014.08.015. Epub 2014 Oct 5.
PMID: 25290356
4. Characterization of anti-silencing factor 1 in Leishmania major.
Scher R, Garcia JB, Pascoalino B, Schenkman S, Cruz AK.
Mem Inst Oswaldo Cruz. 2012 May;107(3):377-86.
PMID: 22510834
5. In silico identification of conserved intercoding sequences in Leishmania genomes: unraveling putative cis-regulatory elements.
Vasconcelos EJ, Terrão MC, Ruiz JC, Vêncio RZ, Cruz AK.
Mol Biochem Parasitol. 2012 Jun;183(2):140-50. doi: 10.1016/j.molbiopara.2012.02.009. Epub 2012 Feb 25.
PMID: 22387760
6. Cell homeostasis in a Leishmania major mutant overexpressing the spliced leader RNA is maintained by an increased proteolytic activity.
Toledo JS, Ferreira TR, Defina TP, Dossin Fde M, Beattie KA, Lamont DJ, Cloutier S, Papadopoulou B, Schenkman S, Cruz AK.
Int J Biochem Cell Biol. 2010 Oct;42(10):1661-71. doi: 10.1016/j.biocel.2010.06.013. Epub 2010 Jun 22.
PMID: 20601086
7. Current treatment and drug discovery against Leishmania spp. and Plasmodium spp.: a review.
Cruz AK, de Toledo JS, Falade M, Terrão MC, Kamchonwongpaisan S, Kyle DE, Uthaipibull C.
Curr Drug Targets. 2009 Mar;10(3):178-92. Review.
PMID: 19275555
8. Leishmania (Viannia) braziliensis transfectants overexpressing the miniexon gene lose virulence in vivo.
de Toledo JS, Junqueira dos Santos AF, Rodrigues de Moura T, Antoniazi SA, Brodskyn C, Indiani de Oliveira C, Barral A, Cruz AK.
Parasitol Int. 2009 Mar;58(1):45-50. doi: 10.1016/j.parint.2008.09.006. Epub 2008 Oct 25.
PMID: 18992366